MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 68571

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021081	CAG	2	6	155061	155066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881804
3502	NC_021081	CAC	2	6	155079	155084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881804
3503	NC_021081	A	6	6	155133	155138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_021081	TG	3	6	155155	155160	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_021081	GCA	2	6	155182	155187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881805
3506	NC_021081	CGG	2	6	155197	155202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881805
3507	NC_021081	G	6	6	155221	155226	0 %	0 %	100 %	0 %	482881805
3508	NC_021081	CGG	2	6	155238	155243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881805
3509	NC_021081	CAGC	2	8	155263	155270	25 %	0 %	25 %	50 %	482881805
3510	NC_021081	TTG	2	6	155274	155279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881805
3511	NC_021081	CTG	2	6	155280	155285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881805
3512	NC_021081	GCC	2	6	155375	155380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881805
3513	NC_021081	GGCCG	2	10	155390	155399	0 %	0 %	60 %	40 %	482881805
3514	NC_021081	CTC	2	6	155450	155455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881805
3515	NC_021081	GGTC	2	8	155467	155474	0 %	25 %	50 %	25 %	482881805
3516	NC_021081	GAT	2	6	155519	155524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881805
3517	NC_021081	TGGT	2	8	155529	155536	0 %	50 %	50 %	0 %	482881805
3518	NC_021081	CAC	2	6	155573	155578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881805
3519	NC_021081	GCG	2	6	155595	155600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881805
3520	NC_021081	T	6	6	155603	155608	0 %	100 %	0 %	0 %	482881805
3521	NC_021081	GCT	2	6	155626	155631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881805
3522	NC_021081	CCT	2	6	155665	155670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881805
3523	NC_021081	TGC	2	6	155674	155679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881805
3524	NC_021081	AGCC	2	8	155780	155787	25 %	0 %	25 %	50 %	482881805
3525	NC_021081	AAG	2	6	155796	155801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881805
3526	NC_021081	T	6	6	155816	155821	0 %	100 %	0 %	0 %	482881805
3527	NC_021081	CATT	2	8	155822	155829	25 %	50 %	0 %	25 %	482881805
3528	NC_021081	CGT	2	6	155874	155879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881806
3529	NC_021081	AGC	2	6	155923	155928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881806
3530	NC_021081	TTG	2	6	155963	155968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881806
3531	NC_021081	GCT	2	6	155970	155975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881806
3532	NC_021081	GCT	2	6	155999	156004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881806
3533	NC_021081	GCCCG	2	10	156021	156030	0 %	0 %	40 %	60 %	482881806
3534	NC_021081	AGC	2	6	156044	156049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881806
3535	NC_021081	AGCTC	2	10	156153	156162	20 %	20 %	20 %	40 %	482881806
3536	NC_021081	GCCC	2	8	156246	156253	0 %	0 %	25 %	75 %	482881806
3537	NC_021081	TCG	2	6	156281	156286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881806
3538	NC_021081	CCCA	2	8	156287	156294	25 %	0 %	0 %	75 %	482881806
3539	NC_021081	GTG	2	6	156311	156316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881806
3540	NC_021081	GGC	2	6	156337	156342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881806
3541	NC_021081	GC	3	6	156447	156452	0 %	0 %	50 %	50 %	482881806
3542	NC_021081	GGT	2	6	156543	156548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881806
3543	NC_021081	GGC	2	6	156558	156563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881806
3544	NC_021081	CCG	2	6	156621	156626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881806
3545	NC_021081	GCC	2	6	156734	156739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881807
3546	NC_021081	CCA	2	6	156801	156806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881807
3547	NC_021081	C	6	6	156849	156854	0 %	0 %	0 %	100 %	482881807
3548	NC_021081	ATCA	2	8	156862	156869	50 %	25 %	0 %	25 %	482881807
3549	NC_021081	ACC	2	6	156897	156902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881807
3550	NC_021081	CAG	2	6	156907	156912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881807
3551	NC_021081	GAAA	2	8	156944	156951	75 %	0 %	25 %	0 %	482881807
3552	NC_021081	TGG	2	6	156954	156959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881807
3553	NC_021081	CACCCC	2	12	157024	157035	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	482881807
3554	NC_021081	AGC	3	9	157073	157081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881807
3555	NC_021081	CAC	2	6	157129	157134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881807
3556	NC_021081	GCA	2	6	157167	157172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881807
3557	NC_021081	CAC	2	6	157183	157188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881807
3558	NC_021081	GAT	2	6	157300	157305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881807
3559	NC_021081	TGT	2	6	157332	157337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881807
3560	NC_021081	GTG	2	6	157379	157384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881807
3561	NC_021081	CAG	2	6	157411	157416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881807
3562	NC_021081	GGCCTG	2	12	157453	157464	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	482881807
3563	NC_021081	CCG	2	6	157602	157607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881807
3564	NC_021081	GCA	2	6	157659	157664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881807
3565	NC_021081	CAG	2	6	157747	157752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881807
3566	NC_021081	CGG	2	6	157802	157807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881807
3567	NC_021081	GCCAGG	2	12	157829	157840	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	482881807
3568	NC_021081	CGG	2	6	157867	157872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881808
3569	NC_021081	GAT	2	6	157878	157883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881808
3570	NC_021081	GAGG	2	8	157929	157936	25 %	0 %	75 %	0 %	482881808
3571	NC_021081	CTG	2	6	157938	157943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881808
3572	NC_021081	GGTC	2	8	158024	158031	0 %	25 %	50 %	25 %	482881808
3573	NC_021081	TGC	2	6	158053	158058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881808
3574	NC_021081	GCT	2	6	158066	158071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881808
3575	NC_021081	G	6	6	158081	158086	0 %	0 %	100 %	0 %	482881808
3576	NC_021081	CCA	2	6	158096	158101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881808
3577	NC_021081	GTGG	2	8	158157	158164	0 %	25 %	75 %	0 %	482881808
3578	NC_021081	CAC	2	6	158172	158177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881808
3579	NC_021081	GAT	2	6	158214	158219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881808
3580	NC_021081	GCG	2	6	158220	158225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881808
3581	NC_021081	GGT	2	6	158244	158249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881808
3582	NC_021081	ACC	2	6	158266	158271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881808
3583	NC_021081	CAC	2	6	158283	158288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881808
3584	NC_021081	GGGCCA	2	12	158294	158305	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	482881808
3585	NC_021081	GCC	2	6	158312	158317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881808
3586	NC_021081	GGT	2	6	158379	158384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881808
3587	NC_021081	CCT	2	6	158477	158482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881808
3588	NC_021081	GGC	2	6	158499	158504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881808
3589	NC_021081	GCA	2	6	158567	158572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881808
3590	NC_021081	GGT	2	6	158598	158603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881808
3591	NC_021081	CAG	2	6	158625	158630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881808
3592	NC_021081	CCA	2	6	158678	158683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881808
3593	NC_021081	AGGGCC	2	12	158780	158791	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	482881809
3594	NC_021081	C	6	6	158802	158807	0 %	0 %	0 %	100 %	482881809
3595	NC_021081	TCA	2	6	158855	158860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881809
3596	NC_021081	CCG	2	6	158907	158912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881809
3597	NC_021081	GCA	2	6	159042	159047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881809
3598	NC_021081	GCT	2	6	159134	159139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881809
3599	NC_021081	GCA	2	6	159141	159146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881809
3600	NC_021081	T	6	6	159151	159156	0 %	100 %	0 %	0 %	482881809
3601	NC_021081	GTG	3	9	159218	159226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881809
3602	NC_021081	CG	3	6	159262	159267	0 %	0 %	50 %	50 %	482881809
3603	NC_021081	TCG	2	6	159296	159301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881809
3604	NC_021081	AGTA	2	8	159311	159318	50 %	25 %	25 %	0 %	482881809
3605	NC_021081	TAA	2	6	159377	159382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_021081	GGA	2	6	159401	159406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_021081	A	6	6	159455	159460	100 %	0 %	0 %	0 %	482881810
3608	NC_021081	CG	3	6	159495	159500	0 %	0 %	50 %	50 %	482881810
3609	NC_021081	CAA	2	6	159508	159513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881810
3610	NC_021081	GTACGA	2	12	159514	159525	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	482881810
3611	NC_021081	TGC	2	6	159558	159563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881810
3612	NC_021081	CAT	2	6	159640	159645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881810
3613	NC_021081	CCAC	2	8	159651	159658	25 %	0 %	0 %	75 %	482881810
3614	NC_021081	GTG	3	9	159674	159682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881810
3615	NC_021081	TGG	2	6	159702	159707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881810
3616	NC_021081	GGC	2	6	159725	159730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881810
3617	NC_021081	ATC	2	6	159740	159745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881810
3618	NC_021081	GTG	2	6	159749	159754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881810
3619	NC_021081	CTT	2	6	159829	159834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881810
3620	NC_021081	CAG	2	6	159944	159949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881810
3621	NC_021081	GCTT	2	8	160063	160070	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3622	NC_021081	CGA	2	6	160151	160156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881811
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3739	NC_021081	TGAA	2	8	165541	165548	50 %	25 %	25 %	0 %	482881817
3740	NC_021081	CGA	2	6	165581	165586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881817
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3990	NC_021081	GCCA	2	8	176844	176851	25 %	0 %	25 %	50 %	482881831
3991	NC_021081	TGG	2	6	176902	176907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881831
3992	NC_021081	TTG	2	6	176913	176918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881831
3993	NC_021081	CAG	2	6	176954	176959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881831
3994	NC_021081	CGC	2	6	176971	176976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881831
3995	NC_021081	GC	3	6	176996	177001	0 %	0 %	50 %	50 %	482881831
3996	NC_021081	AGCC	3	12	177051	177062	25 %	0 %	25 %	50 %	482881831
3997	NC_021081	GAG	2	6	177063	177068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881831
3998	NC_021081	TGGG	2	8	177103	177110	0 %	25 %	75 %	0 %	482881831
3999	NC_021081	G	6	6	177108	177113	0 %	0 %	100 %	0 %	482881831
4000	NC_021081	AGC	2	6	177120	177125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881831

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